Topman Alexandre de Juniac en financieel directeur Pierre-François Riolacci wilden dat KLM overtollig kasgeld zou gaan afstaan aan de holding, zodat die goedkoper zou kunnen lenen. Na verzet vanuit directie en raad van commissarissen van KLM werden die plannen evenwel bijgesteld.
In de raad van bestuur van Air France-KLM zitten, naast de operationele bestuurders van de holding, Air France en KLM, ook toezichthouders. Er zijn zowel Nederlandse als Franse bestuurders, maar de Fransen zijn in de meerderheid.